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发布日期:2024-03-17 11:49    点击次数:68

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  中新网北京7月12日电 (记者 孙自法)海外著名学术期刊《当然》最新在线发表一篇结构生物学论文称,参议东谈主员行使东谈主工智能(AI)时刻驱动,研发出一种能盘算新卵白质的深度学习圭臬,这个名为RoseTTAFold Diffusion(RFdiffusion)的深度学习圭臬能生成多样功能性卵白质,包括在自然卵白质中从未见过的拓扑结构。

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  该论文先容,深度学习鼓励了卵白质结构的意想和盘算,但仍需一个通用框架来克服在卵白质盘算上碰到的多样挑战。扩散模子是一种生成式模拟圭臬,已被泄露在图像和文本生成中很灵验,况且似乎也适用于卵白质盘算。可是,这类模子现在的收遵守并不高,产生的序列基本不行折叠成主义结构。

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  论文通信作家、好意思国华盛顿大学David Baker和共事及互助者开展参议标明,通过细调之前报谈过的RoseTTAFold的结构意想聚积并将其整合到一个降噪扩散模子中,就能生成具有本色兴味的卵白质骨架,皇冠新2网而卵白质骨架决定了卵白质的体式和功能。该模子(RFdiffusion)能测试领有不同结构元素的盘算组合,并从新驱动产生卵白质。RFdiffusion能实践不同的任务,盘算单体(卵白质的基本构成单元)、寡聚体(多亚基聚体)和有调理或工业应用出路的复杂结构,如集结位点。

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  论文作家对数百个盘算出的对称聚体、金属集结卵白和集结卵白的结构和功能进行了实验表征,泄露了该圭臬的实用性。他们还生成了盘算的一种集结卵白与其底物(此处为流感血凝素——在流感病毒名义发现的卵白)的复合物并分析了其结构,发现后果与盘算的模子险些一模相似,从而泄露了该圭臬的准确性。

  论文作家转头合计,RFdiffusion是对现在卵白质盘算圭臬的一次概括纠正,能产生总长度达600个残基的结构,复杂性和准确度王人比之前更高。后续对该圭臬的进一步纠正,或能盘算出复杂流程更高的新卵白。(完)

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